北京大学冷冻电镜平台是学校公共平台建设的重点项目。平台于2015年开始规划，由生科院牵头于同年开始建设，其目标是建成国际一流的高端科研平台，为全校生命科学及相关学科提供全面的冷冻电镜技术服务，促进学科深度交叉融合，助力学校双一流建设。平台建设先后获得了学校“985”经费、生科院学科建设经费、北大-清华联合生命中心的经费支持，现有大型科研仪器包括300 kV场发射冷冻透射电镜Titan Krios 1台，200 kV场发射冷冻透射电镜Talos Arctica 1台，冷冻双束扫描电镜Aquilos 2 1台，冷冻光电关联显微镜Leica CLEM 1台，及电子束和磁控溅射镀膜仪Leica ACE600、快速投入式冷冻制样仪等配套的制样设备。

平台于2017年开始运行，现有专业技术支撑队伍6人，其中3人具有博士学位。平台坚持“服务第一”的理念，提供全年无休的技术服务。主要设备年均服务机时均超过6000 h，已为全校包括生科院、物理学院、未来技术学院、化学学院、医学部等十余个学院（中心）的50多个课题组提供了科研技术服务。平台已经支持了百余篇高水平科研论文的发表，包括16篇Science、Nature、Cell论文。平台获得了授权国家发明专利3项，实用新型1项。